En un estudio reciente publicado en Genome Announcements (Bohle et al., 2014), ADL Diagnostic Chile entregó evidencia científica respecto de las diferencias a nivel genómico existente entre dos genogrupos de Piscirickettsia salmonis claramente distinguibles. Estas evidencias fueron descubiertas por el laboratorio hace algunos años, y desde esa fecha al día hoy se ha obtenido información relevante para la industria salmonera mediante la vigilancia molecular llevada a cabo con sus clientes.
La investigación responde a la problemática de explicar los hallazgos fenotípicos asociados a casos Piscirickettsiosis (SRS) acumulados durante años de trabajo diagnóstico. En concreto, se reporta la secuenciación de los genomas de dos aislados de campo de P. salmonis recuperados de distintas especies de salmónidos: un aislado similar a LF-89 (B1-32597, salmón coho) y otro similar a EM-90 (A1-15972, salmón del Atlántico). Ambos aislados pertenecen a genogrupos distintos designados arbitrariamente como genogrupo B (clásico, presente en Chile hace más de 25 años), y otro denominado genogrupo A. Las secuencias de los genomas de alta calidad se compararon por herramientas bioinformáticas, encontrándose una serie de deleciones (pérdida de secuencias de ADN) en el genoma del aislado genogrupo A (A1-15972, tipo EM-90).
Entre las deleciones destaca la ausencia de uno de los tres sistemas de secreción tipo 4 (T4SS) encontrados en el aislado genogrupo B. Estos T4SS son importantes factores de virulencia de patógenos de plantas y animales que sirven para el establecimiento de la infección. Las deleciones en el aislado genogrupo A podrían estar relacionadas con una adaptación a un hospedero específico, ya que este tipo de aislados han sido recuperados hasta al momento exclusivamente desde salmón del Atlántico (datos de ADL no publicados).
La investigación confirma análisis previos realizados con otros marcadores genéticos como los ITS (internal transcribed sequence) (Mauel et al., 1999), pero además aporta nuevos antecedentes respecto de las diferencias genéticas relacionadas al fenotipo de bacterias del genogrupo A. Adicionalmente, los resultados sugieren que esta variante tendría diferencias antigénicas respecto de cepas tipo LF-89 (genogrupo B).
A la fecha, ADL Diagnostic Chile cuenta con información fenotípica y genotípica de una colección que incluye más de 450 aislados de P. salmonis georreferenciados, cuya distribución en la industria es amplia. Nuevos estudios recientemente finalizados, y otros en curso, permitirán mejorar la comprensión de la enfermedad (SRS) y contribuir a su control y prevención.
http://genomea.asm.org/content/2/6/e01219-14.full
