El estudio, recientemente publicado en Genome Announcements (Bohle y col., 2014), responde a la problemática de explicar los hallazgos fenotípicos asociados a casos de Piscirickettsiosis (SRS) acumulados durante años de trabajo diagnóstico. En concreto, de acuerdo con lo informado por el laboratorio de diagnóstico, se reporta la secuenciación de los genomas de dos aislados de campo de P. salmonis recuperados de distintas especies de salmónidos: un aislado similar a LF-89 (B1-32597, salmón Coho) y otro similar a EM-90 (A1-15972, salmón Atlántico).
Ambos aislados pertenecen a genogrupos distintos, designados arbitrariamente como genogrupo B (clásico, presente en Chile hace más de 25 años), y otro denominado genogrupo A. Las secuencias de los genomas de alta calidad se compararon por herramientas bioinformáticas, encontrándose una serie de deleciones (pérdida de secuencias de ADN) en el genoma del aislado genogrupo A (A1-15972, tipo EM-90). Asimismo, ADL Diagostic Chile precisó que, entre las deleciones, destaca la ausencia de uno de los tres sistemas de secreción tipo 4 (T4SS) encontrados en el aislado genogrupo B. Estos T4SS son importantes factores de virulencia de patógenos de plantas y animales que sirven para el establecimiento de la infección. Las deleciones en el aislado genogrupo A podrían estar relacionadas con una adaptación a un hospedero específico, ya que este tipo de aislados han sido recuperados hasta al momento exclusivamente desde salmón Atlántico (datos de ADL no publicados). “La investigación confirma análisis previos realizados con otros marcadores genéticos como los ITS (internal transcribed sequence) (Mauel et al., 1999), pero además aporta nuevos antecedentes respecto de las diferencias genéticas relacionadas al fenotipo de bacterias del genogrupo A. Adicionalmente, los resultados sugieren que esta variante tendría diferencias antigénicas respecto de cepas tipo LF-89 (genogrupo B)”, precisó el laboratorio.
A la fecha, ADL Diagnostic Chile cuenta con información fenotípica y genotípica de una colección que incluye más de 450 aislados de P. salmonis georreferenciados, cuya distribución en la industria es amplia. Nuevos estudios recientemente finalizados, y otros en curso, permitirán mejorar la comprensión de la enfermedad (SRS) y contribuir a su control y prevención.